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An in vivo genetic reversion highlights the crucial role of Myb-Like, SWIRM, and MPN domains 1 (MYSM1) in human hematopoiesis and lymphocyte differentiation - 04/12/15

Doi : 10.1016/j.jaci.2015.06.008 
Tangui Le Guen, PhD a, b, Fabien Touzot, MD, PhD a, b, c, Isabelle André-Schmutz, PhD b, c, Chantal Lagresle-Peyrou, PhD b, d, Benoit France, MSc a, b, Laetitia Kermasson a, b, Nathalie Lambert c, e, Capucine Picard, MD, PhD b, c, e, Patrick Nitschke, PhD f, Wassila Carpentier, PhD g, Christine Bole-Feysot, PhD h, Annick Lim, PhD i, Marina Cavazzana, MD, PhD b, e, Isabelle Callebaut, PhD j, Jean Soulier, MD, PhD k, Nada Jabado, MD, PhD l, Alain Fischer, MD, PhD b, c, Jean-Pierre de Villartay, PhD a, b, Patrick Revy, PhD a, b,
a INSERM UMR 1163, Laboratory of Genome Dynamics in the Immune System, Paris, France 
b Paris Descartes–Sorbonne Paris Cité University, Imagine Institute, Paris, France 
c AP-HP, Hôpital Necker Enfants-Malades, Service d'Immunologie et d'Hématologie Pédiatrique, Paris, France 
d CIC-BT 502 INSERM, Paris, France, and Département de Biothérapie, AP-HP, Hôpital Necker-Enfants Malades, Paris, France 
e Study Center of Primary Immunodeficiencies, AP-HP, Necker Hospital, Paris, France 
f Service de Bioinformatique, Faculté de Médecine Pitié Salpêtrière, Paris, France 
g Plateforme Post-Génomique P3S, Faculté de Médecine Pitié Salpêtrière, Paris, France 
h Plateforme de génomique, Institut Imagine, Paris, France 
i Institut Pasteur, Groupe Immunoscope, Département d'Immunologie, Paris, France 
j CNRS UMR7590, Sorbonne Universités, Université Pierre et Marie Curie-Paris6–MNHN–IRD–IUC, Paris, France 
k INSERM U944, Institut universitaire d'Hématologie, Université Denis Diderot, Paris, France 
l McGill University and the Genome Quebec Innovation Centre, Montreal, Quebec, Canada 

Corresponding author: Patrick Revy, PhD, INSERM UMR 1163, Laboratory of Genome Dynamics in the Immune System, Equipe labélisée “La Ligue,” Institut Imagine, 24 bd du Montparnasse, 75015 Paris, France.

Abstract

Background

Myb-Like, SWIRM, and MPN domains 1 (MYSM1) is a metalloprotease that deubiquitinates the K119-monoubiquitinated form of histone 2A (H2A), a chromatin marker associated with gene transcription silencing. Likewise, it has been reported that murine Mysm1 participates in transcription derepression of genes, among which are transcription factors involved in hematopoietic stem cell homeostasis, hematopoiesis, and lymphocyte differentiation. However, whether MYSM1 has a similar function in human subjects remains unclear. Here we describe a patient presenting with a complete lack of B lymphocytes, T-cell lymphopenia, defective hematopoiesis, and developmental abnormalities.

Objectives

We sought to characterize the underlying genetic cause of this syndrome.

Methods

We performed genome-wide homozygosity mapping, followed by whole-exome sequencing.

Results

Genetic analysis revealed that this novel disorder is caused by a homozygous MYSM1 missense mutation affecting the catalytic site within the deubiquitinase JAB1/MPN/Mov34 (JAMM)/MPN domain. Remarkably, during the course of our study, the patient recovered a normal immunohematologic phenotype. Genetic analysis indicated that this improvement originated from a spontaneous genetic reversion of the MYSM1 mutation in a hematopoietic stem cell.

Conclusions

We here define a novel human immunodeficiency and provide evidence that MYSM1 is essential for proper immunohematopoietic development in human subjects. In addition, we describe one of the few examples of spontaneous in vivo genetic cure of a human immunodeficiency.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Key words : Hematopoiesis, immunodeficiency, MYSM1, genetic reversion, histone deubiquitinase

Abbreviations used : APC, H2A, HSC, JAMM, KO, MYSM1, NK, PE, WGHM, WT


Plan


 Supported by institutional grants from INSERM, Ligue Nationale contre le Cancer (Equipe Labellisée La Ligue), GIS-Institut des maladies rares, ARC, INCa/Cancéropôle Ile de France, Institut Imagine, and the European Research Council (PIDIMMUN grant no. 249816). This program has received a state subsidy managed by the National Research Agency under the “Investments for the Future” program bearing the reference ANR-10-IAHU-01. T.L.G received fellowships from La Ligue contre le cancer, and B.F. received fellowships from Canceropôle. P.R. is a scientist from Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS).
 Disclosure of potential conflict of interest: P. Revy received research support from ARC, La Ligue, INCa, ANR, GIS-Institut des European Research Council. The rest of the other authors declare that they have no relevant conflicts of interest.


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Vol 136 - N° 6

P. 1619 - décembre 2015 Retour au numéro
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